Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMOD4Q9NZQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD4Q9NZQ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD4Q9NZQ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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