Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EHD3Q9NZN3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms