Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYOFQ9NZM1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYOFQ9NZM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYOFQ9NZM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms