Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRN3Q9NYV6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RRN3Q9NYV6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRN3Q9NYV6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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