Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPD3Q9NY59 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPD3Q9NY59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms