Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM260Q9NX78 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM260Q9NX78 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms