Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRNAU1APQ9NX07 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRNAU1APQ9NX07 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms