Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
OXSMQ9NWU1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OXSMQ9NWU1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms