Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IMP3Q9NV31 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP3Q9NV31 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP3Q9NV31 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms