Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCP11L1Q9NUJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCP11L1Q9NUJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCP11L1Q9NUJ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCP11L1Q9NUJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms