Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNTG1Q9NSN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNTG1Q9NSN8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms