Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNIP2Q9NS61 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNIP2Q9NS61 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms