Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMPRSS4Q9NRS4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms