Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPHK2Q9NRA0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPHK2Q9NRA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPHK2Q9NRA0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms