Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRDM10Q9NQV6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM10Q9NQV6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms