Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FSCN3Q9NQT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FSCN3Q9NQT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms