Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD93Q9NPY3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD93Q9NPY3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD93Q9NPY3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms