Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MID1IP1Q9NPA3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MID1IP1Q9NPA3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MID1IP1Q9NPA3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms