Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTA1Q9NP79 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTA1Q9NP79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms