Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRMS1Q9HCU9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRMS1Q9HCU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRMS1Q9HCU9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms