Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMARCAD1Q9H4L7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMARCAD1Q9H4L7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms