Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXF3Q9H4D5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXF3Q9H4D5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXF3Q9H4D5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms