Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHMP4BQ9H444 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHMP4BQ9H444 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CHMP4BQ9H444 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms