Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA6AQ9H2E6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA6AQ9H2E6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA6AQ9H2E6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms