Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIL1Q9H173 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIL1Q9H173 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIL1Q9H173 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms