Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
POLR2J2Q9GZM3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLR2J2Q9GZM3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms