Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC27Q9C0I9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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LRRC27Q9C0I9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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LRRC27Q9C0I9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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LRRC27Q9C0I9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC27Q9C0I9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC27Q9C0I9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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