Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTMR12Q9C0I1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MTMR12Q9C0I1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTMR12Q9C0I1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms