Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA4CQ9C0C4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SEMA4CQ9C0C4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms