Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
INO80BQ9C086 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
INO80BQ9C086 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
INO80BQ9C086 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms