Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM7Q9C029 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM7Q9C029 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms