Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EDEM3Q9BZQ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EDEM3Q9BZQ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms