Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL4Q9BYD3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL4Q9BYD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL4Q9BYD3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms