Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHANK3Q9BYB0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHANK3Q9BYB0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SHANK3Q9BYB0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms