Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CADM1Q9BY67 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CADM1Q9BY67 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CADM1Q9BY67 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms