Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC8Q9BY41 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC8Q9BY41 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC8Q9BY41 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms