Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A5Q9BY07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC4A5Q9BY07 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms