Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CARD11Q9BXL7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CARD11Q9BXL7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CARD11Q9BXL7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CARD11Q9BXL7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms