Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1QTNF3Q9BXJ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C1QTNF3Q9BXJ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms