Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LSM14BQ9BX40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LSM14BQ9BX40 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms