Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SYCP2Q9BX26 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYCP2Q9BX26 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYCP2Q9BX26 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms