Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RPAP1Q9BWH6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RPAP1Q9BWH6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms