Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSBP4Q9BWG4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP4Q9BWG4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms