Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM2Q9BVW6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms