Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NDFIP1Q9BT67 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDFIP1Q9BT67 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDFIP1Q9BT67 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms