Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FYCO1Q9BQS8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FYCO1Q9BQS8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FYCO1Q9BQS8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms