Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BPIFA3Q9BQP9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BPIFA3Q9BQP9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BPIFA3Q9BQP9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms