Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TREX2Q9BQ50 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TREX2Q9BQ50 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TREX2Q9BQ50 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms