Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM7Q9BQ49 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMIM7Q9BQ49 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms