Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDX50Q9BQ39 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX50Q9BQ39 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms